Website chứa các liên kết tải xuống độc hại

Dạo gần đây webmatter liên tục thông báo chứa các liên kết đến nội dung tải xuống hoặc trang web độc hại rồi dọa có thể hiển thị trên kết quả tìm kiếm thông tin như vậy. Sau mỗi lần có thông báo như vậy thì mình chỉ cần gửi yêu cầu xác minh lại là google lại kêu mình không còn chứa các liên kết đến nội dung tải xuống hoặc trang web độc hại nữa trong khi mình không có sửa đổi tý gì cả.

Mình mới làm SEO cho một công ty phần mềm. Đặc thù bên mình là có các link cài đặt phần mềm là bản dùng thử hoặc bản cài sản phẩm cho nhân viên tải xuống và cài đặt cho khách hàng và lấy luôn link tải là domain chính dạng domain(.)vn/upload/tenphanmem. Mình có thử cài một số sản phẩm mà công ty xây dựng cho khách hàng thì những sản phẩm này thường xuyên bị smartscreen cảnh báo là không an toàn nên mình nghĩ nguyên nhân bắt đầu từ đây
Mình đã chặn bot đọc file bằng cách thêm dòng Disallow: /upload/ trong file robot rồi nhưng tình trạng này vẫn tiếp tục xảy ra.
Bước đầu em định đề xuất chuyển hết các link tải phần mềm này vào một subdomain rồi chặn bot hoàn toàn, không biết làm như vậy có còn bị cảnh báo không? Các thánh chỉ giáo cho để em có phương án đề xuất. Bên em nhiều kỹ thuật nhưng SEO mù tịt luôn.